Договор между муниципальными предприятиями

такой договор составляется как обычный гражданско-правовой договор. Единственное, что нужно помнить - это наличие соответствующих полномочий на совершение сделок, на них в таком договоре нужно сослаться (указать, на основании каких документов были получены соответствующие полномочия)
По своей правовой природе такой договор может использовать разные модели, в зависимости от вида имущества: это может быть, например, аренда, хранение, агентский договор, возмездное оказание услуг и др.
Если имущество недвижимое, то, думается, логично было бы использовать модель договора аренды Можно дополнить его специфичными для Вашего случая условиями.

Следует обратить внимание на то, что правоспособность унитарных предприятий является специальной, то есть унитарное предприятие может осуществлять только те действия, которые прямо предусмотрены в его Уставе, и совершать сделки, необходимые для достижения уставных целей.. Если Устав МУП не содержит указание на возможность осуществлять услуги такого типа, то договор будет признан недействительным.